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(一)治疗
新生儿肝炎病原不一，但基本治疗措施相同。包括护肝治疗和针对病因的治疗。新生儿乙型肝炎仍无特效治疗，除营养、激素、维生素以外，有人试用干扰素及干扰素诱导剂、转移因子、免疫核糖核酸(iRNA)、乙肝病毒表面抗原 HBsAg (HBsAg疫苗)、左旋咪唑、泛癸利酮(辅酶Q10)静脉滴注血凝素等。以上均为激活机体免疫功能的方法，部分病例有效。
1.病因治疗 ①选用抗病毒药物;②选用敏感抗生素控制原发细菌感染;③对先天性代谢异常者，应给予特殊饮食治疗。应用乙肝高价免疫球蛋白和乙肝疫苗治疗HBV感染已有良好疗效。阿昔洛韦(无环鸟苷)有干扰HSV-DNA的作用，抑制病毒DNA的复制，是治疗HSV感染的较理想药物。用法：每次5mg/kg，静脉滴注，3次/d，连用1周。
2.营养 由于患儿常因食欲不振及脂肪吸收不良导致热卡和必需脂肪酸、脂溶性维生素缺乏，因而应注意营养平衡。禁食者每天要有一定量的糖类供应，但由于肝脏疾患则亦影响耐糖能力，故不宜糖分过多，葡萄糖可按8～12mg/(kg·min)计算给予。肝脏从门脉血摄取氨基酸以合成蛋白，当肝脏有疾患时宜供应一般量的蛋白，勿使超负荷，才符合生理。
在肝脏功能障碍时，可有苏氨酸、色氨酸、甲硫氨酸和胱氨酸的升高，加上婴幼儿本来对芳香族氨基酸代谢功能不全，故苯丙氨酸和酪氨酸亦可增高，因之在重症肝炎或胆道闭锁时，应投予肝用氨基酸输液(支链氨基酸：缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸)，该类氨基酸可在肝外组织进行代谢，促进蛋白合成。脂肪供应则宜减少，肠内胆盐的减少不仅影响对食物中脂肪的分解和吸收，而且有促使肝和小肠合成胆固醇增多之弊端。注意补充维生素A、K、D、E，应肌内注射。
3.激素 泼尼松(强的松)2mg/(kg·d)部分病例有一定疗效，在症状明显好转后逐步减量，其作用可能在消除肝细胞肿胀，减轻黄疸，并延迟肝组织的纤维化等方面。疗程按临床情况而定，一般共用4～8周，需注意预防其他感染，此外地塞米松等亦可应用。目前对激素的临床应用价值尚有争论。
4.保肝利胆药退黄
(1)门冬氨酸钾镁：通过提高细胞内钾镁离子的浓度，加速细胞内三羧酸循环，从而改善肝功能，降低血清胆红素。用法：每次0.2～0.4ml/kg，静脉滴注，1～2次/d，亦可口服。
(2)低分子右旋糖酐或小剂量山莨菪碱(654-2)静脉滴注3～5天，有助于疏通胆小管，达到利胆退黄作用。前者用量每次5～10ml/kg，后者用量每次0.2～2mg/kg。
(3)牛磺胆酸钠：每次50mg，1～3次/d。
(4)苯巴比妥：有改善酶合成及提高酶活力，促进胆汁排泄双重作用。用法：每次1.5～2.5mg/kg，3次/d。
(5)其他药物：甘草酸二钠(甘利欣)、三磷腺苷(ATP)、辅酶A( CoA)、多种氨基酸(肝安注射液)及多种维生素均有利于改善肝细胞功能。
5.防治并发症
(1)维生素K：防止出血倾向，用法：10mg/d，静脉滴注，1次/d，连用3天。
(2)维生素D3：30万U肌注1次，同时给予10%葡萄糖酸钙溶液10ml，加等量葡萄糖溶液，静脉滴注，治疗佝偻病及低钙惊厥。
(3)静脉用人血丙种球蛋白：有助于提高机体抗感染能力，必要时可应用。
(4)抗生素：防治感染，应选择对肝肾功能影响小的敏感抗生素。
(5)其他措施：针对有关并发症采取必要的治疗措施。
6.对铜代谢的观察 已知28～36周的胎儿，每天经胎盘从母体聚集80～90µg的铜，怀孕40周的胎儿体内已聚集20mg铜，约50%的铜存在于肝脏内，单位重量含铜量比成人高5～10倍，胆汁是铜的主要排泄途径，10%由小肠壁排出，4%由肾脏排出，有报道有些肝炎病儿的肝脏铜含量可达很高水平，建议试用青霉胺治疗。
7.肝脏移植 α1抗胰蛋白酶缺乏症可出现进行性肝硬化，肝脏移植是本症的根治方法。
(二)预后
与病因、病期有关，轻症预后好，发生严重并发症者病死率高。
