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1.常规检查 血常规，血小板，出、凝血时间，凝血酶原时间等一般性检查。全身性出、凝血疾病时，出、凝血相检查有异常改变，如DIC或维生素K缺乏症等。先天性同种免疫性或被动免疫性血小板减少性紫癜或各种先天性凝血因子缺乏症出、凝血相异常。
2.粪便检查 发现红细胞，潜血试验强阳性。急性胃肠炎患儿可有黏液血便，鲜血便等。
3.Apt试验 以鉴别血液为母血还是新生儿自身的血。取婴儿呕吐物或粪便中血性物，加5倍水搅匀，以2000转/min速率离心2min，取粉红色上清液(5份)于试管内，加1%氢氧化钠(1份)，2min后观察结果，若试液由粉红色转变成黄棕色，示为成人型血红蛋白(HbA) 说明血液为母血;如仍为粉红色则血液来自新生儿，新生儿咽入自己鼻咽腔或气道中的血液，主要为胎儿型血红蛋白(HbF)。
1.内镜
(1)纤维食管镜、胃镜、十二指肠镜检查：它优于X线钡剂造影，确诊率达75%～90%，而后者仅为50%。能确定Treitz韧带以上或以下部位出血;能看到出血来源(阳性率为77%)及具体出血情况;能在直视下进行活检和止血;并能观察到X线检查不易发现的浅表、微小病变;在急性出血时亦可进行检查。小儿用GIF-P2或GIF-P3型镜，在全麻或局麻加安定及阿托品下进行，镜检前必须纠正凝血障碍和血流动力学的不稳定状态，保持呼吸道通畅，并用抗生素预防感染。
(2)纤维直肠镜、结肠镜检查：首先进行直肠镜检查。做结肠镜检查前，一般先做钡灌肠检查，此与上消化道镜检查有所不同。用PCF(Olympus)或FC-34MA型内镜，小婴儿也可用小口径胃镜替代。
2.X线检查
(1)腹部平片：采取仰卧、直立或侧卧位腹部平片，可排除肠梗阻和肠穿孔，对新生儿小肠扭转、坏死性肠炎及胎粪性腹膜炎尤为重要。
(2)钡剂造影：稀钡餐在非急性出血期造影是有一定价值的，常常加甲基纤维素作双层对比。也可在十二指肠插管后注入钡剂作小肠造影检查(加或不加甲基纤维素)。钡灌肠常有助于肠套叠之诊断。
3.核素扫描 是一种有效而准确的检查方法。利用99mTc-硫胶或其他锝酸盐标记的红细胞扫描，对亚急性或间歇性出血者最有价值。假阳性达15%，而假阴性达25%。
4.血管造影术 用于1.5～2.0ml/min以上的出血病例检查。对出血量大不能手术的病例，可试用栓塞法止血。但因有上述一系列更先进无损伤的检查方法，故目前此方法已很少用。