肠蠕动减慢可能会被误认为或与一些疾病或症状相混淆，因为可能表现出相似的症状，例如腹胀、便秘、不适感等。
功能性便秘这是一种常见的疾病，表现为排便困难、排便频率减少等症状，通常没有明显的器质性疾病作为基础。
慢性肠炎如克罗恩病和溃疡性结肠炎等，这些疾病会引起肠道炎症反应，导致腹痛、腹泻等症状。
部分或完全的肠道阻塞会导致腹部疼痛、呕吐、腹胀以及排便或排气减少等症状。
肠易激综合征的特点是反复发作的腹痛，常伴有便秘或腹泻。盆底肌肉的功能异常会影响排便过程，导致排便困难。
神经系统疾病如帕金森病、多发性硬化等，这些疾病可能影响到控制肠道运动的神经，导致肠蠕动减弱。
某些药物，尤其是止痛药、抗抑郁药等可能会减缓肠道蠕动，从而引起便秘。
甲状腺功能减退可以减慢新陈代谢，包括肠道的蠕动速度。长期未得到良好控制的糖尿病可能损伤支配肠道的神经，进而导致肠蠕动减慢。