许多病例通过仔细分析病史和上述检查的初步结果，往往可以得出正确诊断。
若诊断仍不清楚，可进一步作X线呗灌肠和钡餐检查，和(或)直、结肠镜检查。如仍无明确结论，则须根据不同情况选用超声、CT、内镜逆行胆胰管造影(ERCP)等影象诊断方法以检查胆、胰疾病，或进行小肠吸收功能试验、呼气试验、小肠粘膜活检以检查小肠吸收不良。
婴幼儿腹泻容易与哪些疾病混淆
1.杆菌痢疾 婴儿痢疾表现多不典型。常无脓血便，临床呈一般腹泻的表现,较难鉴别.应注意流行情况，常能问出接触史。排便前常哭闹,显示里急后重.仔细观察可见患儿大便频繁，但每次量不多,有时可见水样便粪质中混有脓血，镜下有较多脓细胞、红细胞和吞噬细胞。而大肠杆菌肠炎每次便量多，一部分每次可达20ml以上，大便中粘液常见，但极少稠脓，偶有少数白细胞与红细胞，应培养鉴别。
2.婴儿出血性肠炎 起病与大肠杆菌肠炎无异，但治疗后腹泻不止且病情加重，腹胀较重，高热。频繁呕吐，重者吐咖啡样物。大便早期呈水样，潜血试验阴性，以后出现典型的暗红色果酱样大便。脱水重，可早期出现休克。中毒症状重者可昏迷、惊厥。
3.“生理性腹泻” 渗出性体质小儿可生后不久即开始排黄绿色稀便，大便次数多，但不吐，食欲好，体重增加正常。到添加辅食后大，便自然恢复正常。
防积滞伤及脾胃，戒烟酒，忌过食辛辣，以避免对胃粘膜的反复刺激，保持心情舒畅，以免情志刺激。