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本菌感染后的临床表现多种多样，因感染部位不同而异。常见的临床表现有发热，以轻度或中度不规则发热为多，部分为弛张热。重者如脑膜炎、肺炎、败血病等体温较高，毒血症较重。婴儿感染后有神态萎靡、少动、少哭、推食、呕吐等中毒症状。
1.脑膜脓毒黄杆菌 本属中公认的致病菌。菽氏统计该菌引起的77例化脓性脑膜炎，新生儿占96.1%，儿童占1.3%，成人占2.6%。成人病例多见于年老体弱者。
陈氏报告1例肺炎，患者入院痰培养为变形杆菌，左肺尖外大片高密度影。曾给红霉素及头孢哌酮，一度好转，入院第3周发热又起，左心缘房胸片显示大片模糊影，左下肺底积液及外下包裹积液。痰培养3次该菌(FM)。除对羧苄西林、四环素中度敏感外，对其他多种青霉素、头孢菌素、氨基甙类、氯霉素及磺胺甲?唑等均耐药。患者因昏迷，给人工机械通气，用四环素及青霉素病情好转。但气管插管脱出，又发生消化道出血，因吸入窒息而死。晏氏也曾报告1例患结节性弹力纤维变性伴黑头综合征，胸片为双下肺炎，疑双侧胸腔积液。抽取胸水620ml，为渗出液，后变为血性。入院1周痰培养为此菌，5天后变为纯培养，两天后死亡。
据Olsen检查男女泌尿生殖器的27600例体检中，检出114例脑膜败血性黄杆菌，其中来自女性者有100株。因此他认为女性生殖器可能成为该菌在医院的感染源，应引起足够的重视。同时他还在医院不同部位采集269份标本进行培养，其中33份阳性，在住院病人及医务人员中，也发现有呼吸道带菌者，甚至有报道，在消毒器械用的1‰氯己定浸液中也发现有此菌。
FM的治疗较为困难，因其对大多数抗生素耐药。曾有报道FM对红霉素、利福平、SMZco等少数几种抗生素敏感。Brown等对20株来自呼吸道的FM进行检测，全部对所试抗生素(包括第三代头孢霉素)均不敏感。惟独环丙沙星全部敏感。其中5例肺炎经环丙沙星治疗后，2例死亡，3例明显改善。Scully也报告FM对环丙沙星敏感。提示它可能为治疗FM的有效药物。值得注意的是，FM爆发流行。Brown 1989年曾报告为了防止绿脓杆菌感染，预防性的给予多黏菌素B雾化吸入，结果导致FM呼吸道感染流行，在两个半月时间内，在9例监护病人的20次痰培养中分离到FM，其中5例为FM肺炎。我国尚无大数例的肺炎报道，只能从个案报道中体会本菌肺炎的特点。
2.香气黄杆菌 1920年首先从肠道病人粪便中检出，其后在尿、血、痰、创伤和溃疡表面发现。金氏等曾报告1例急症脑内血肿患者，术后第4天，体温升高，呼吸困难，痰量增多，呈黄白色黏痰，有水果味。查体双肺有细?音，少量哮鸣音。白细胞23.7×109/L，胸片双下肺感染。住院期间3次痰培养均示非发酵菌科黄杆菌，属芳香黄杆菌纯生长，菌株产生不溶性黄色素，有特殊芳香味，氧化酶试验阳性。先后予头孢他啶、氯霉素、苯唑西林等静滴，庆大霉素雾吸，酮康唑鼻饲等治疗，无效死亡。
3.多食黄杆菌、食酒精黄杆菌、黄杆菌Ⅱb群在临床可从痰、血、腹水、脑脊液、伤口、尿等中分离出，但报道较少。短黄杆菌及大比目鱼黄杆菌的致病性尚未确定，待积累资料后判定。汪氏等报告1例黄杆菌肺炎合并抗利尿激素综合征，患者低钠血症、血浆渗透压低于尿渗透压，且排除了其他原因，经相应治疗治愈出院。
因为黄杆菌感染的临床表现特异性不强，单纯从临床表现判断出是本菌感染是困难的，必须迅速取得标本，分离该菌。以血液琼脂或麦康凯琼脂平板，30℃培养18～24h挑取可疑菌落接种TSI，30℃ 24h培养，高层和斜面不产酸，氧化酶阳性，菌苔黄色，略带黏性，可疑黄杆菌，待进一步鉴定。下一步是定属，O-F试验为氧化型，产黄色素(少数不产生)，不扩散至培养基内;无动力，无芽孢;具有氧化酶和过氧化氢酶;革兰阴性杆菌或球杆菌。再下一步是定种，以生化试验确定菌种。重要的是上述脑膜脓毒黄杆菌与6群黄杆菌的鉴定，上已述及。