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1.躯体症状 潜伏期一般为10～14天。
(1)初期：发病在1～3天内，起病急，主要症状为发热，1～2天内体温可达39～40℃。伴有头痛、恶心呕吐，腹痛、腹泻及轻度意识障碍，如倦怠、嗜睡等。
(2)极期：发病第4～10天，主要表现为高热、抽搐、昏迷、呼吸衰竭等。神经系统体征通常1周内达高峰，可见震颤、痉挛、各种不同的瘫痪、腱反射消失，脑神经障碍、脑膜刺激症状以及自主神经障碍尿失禁或尿潴留等。
(3)后期：可遗留有迟钝、流涎、失语或口齿不清、震颤、共济失调、不同程度的瘫痪或表现单纯性意识障碍，手足徐动症、癫痫大发作或杰克逊癫痫，此时病人可伴有癫痫性格。帕金森综合征的表现较轻，并可好转。有些病人有言语障碍，表现为不会说话、口吃或拼音不清楚等。一般6个月恢复，少数可持续较长时间。
2.精神症状 精神症状的轻重、病程长短依原发病而改变。一般讲，随躯体症状恢复而日趋好转，少数可持续1～2年;或随疾病后遗症出现而呈慢性期精神症状表现。
(1)早期或急性期症状：
①意识障碍：可见各种不同程度(由混浊到昏迷)的意识障碍，此时定向力不完整。可有运动性兴奋等。
②幻觉妄想状态：病人呈无欲无力状态，思维迟钝或不连贯，表情呆板，动作少而慢。妄想多在幻觉基础上产生，以成年人多见，而且多在轻度意识障碍时出现。
③感知综合障碍：有些病人有明显的视物显大、视物显小、视物变形以及体形感知综合障碍。所有这些也是多在意识障碍的基础上产生的。
④紧张综合征：多见于儿童。少数病人可出现脑衰弱综合征。以及失眠、健忘、表情呆板、情感迟钝或易激惹、注意力涣散等症状。
(2)后期或慢性期精神症状：
①人格改变：病人变得幼稚、易冲动、好攻击人、报复他人、情绪不稳或缺乏克制能力。有的缺乏主动性及应有的情感反应，意志意向活动减弱，孤僻、死板。有的病人变得自私，易记仇。也有的病人表现为行为轻率，变得举止轻浮，性的意向增强，偷窃、说谎等。成年人多见。
②智能障碍：常是精神发育迟滞的主要原因。在发病初期病情严重儿童多见，出现痴呆程度较重且恢复较差。
③行为异常：在儿童中多见，表现好动、冲动、喜恶作剧、破坏行为及手足徐动、痉挛性瘫痪等。
一般可根据病史、体征及实验室检查(参看传染科相关章节)，并参考流行季节(多在夏秋两季)以进行诊断。
1.起病急，明确的发病季节和感染史。
2.明确的躯体症状和神经系统体征，如高热、脑膜刺激征等。
3.精神症状以意识障碍为主，可伴有精神运动性兴奋、幻觉、妄想、感知综合障碍和紧张综合征。后遗症状以人格改变、智能障碍、行为异常为主。
4.实验室检查可见脑脊液压力升高，白细胞升高，补体结合试验、血清抗体试验呈阳性等。